元清觀的格局主要可分為前殿、正殿、後殿

前殿的外觀是重簷式屋頂，門前有青斗石石獅、磚雕、交趾陶等精美藝術。

正殿主要供奉玉皇大帝，殿內的石雕龍柱、大木作、柱上斗栱呈現出精美的設計。

後殿主供奉觀士音菩蕯、十八羅漢等神明。